本廠於日據時期原屬宜蘭振拓產業株式會社花蓮港稻住工場，大正2年（1913）時，宜蘭振拓株式會社在花蓮港街租得土地1,520坪，成立「花蓮港工場」。於民國11年(1922)5月5日臺灣酒類專賣令公佈，同年7月1日由臺灣總督府接管，當時產製之酒類以米酒、糖蜜酒和紅露酒為主。民國33年(1944)因戰爭遭受盟軍空襲，主要廠房生產設備悉被炸燬，生產陷於停頓。
民國36年臺灣省專賣局改稱「臺灣省專賣局酒業事業有限公司」，花蓮酒廠也改稱為「第八酒廠」。逐漸恢復生產各種酒類。民國39年(1950)以後又增產太白酒、五加皮酒、福壽酒等。民國46年(1957)元月本廠正式命名為台灣菸酒公賣局花蓮酒廠，爾後陸續開發其他種酒類，其中以紹興酒最為成功。
原廠址位於花蓮市中心，為配合地方都市發展，並依照省府變產置產政策，於美崙工業區購置土地籌建新廠，民國77年(1988)4月30日完成遷廠繼續生產營運，主要產品為米酒與紹興酒，並研發蓮香酒、小米酒及結合地方人風土民情設計之蓮香老窖系列美酒等。民國91年(2002)7月1日改制為台灣菸酒股份有限公司花蓮酒廠，發展至2025年生產產品也擴增多樣化，主要有:米酒系列、小米酒、米酒水、黃金純麥威士忌、單一穀類威士忌(小米波本橡木桶)、黃金高粱酒系列、黃金竹葉青、手工精釀啤酒等。
